Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcntP48725 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcntP48725 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcntP48725 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcntP48725 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcntP48725 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcntP48725 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcntP48725 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcntP48725 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcntP48725 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcntP48725 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcntP48725 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcntP48725 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcntP48725 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcntP48725 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcntP48725 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcntP48725 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcntP48725 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PcntP48725 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms