Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms