Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpiaP47968 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms