Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms