Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms