Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf1P46099 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms