Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr3P43300 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr3P43300 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr3P43300 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr3P43300 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr3P43300 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr3P43300 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr3P43300 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr3P43300 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr3P43300 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr3P43300 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Egr3P43300 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr3P43300 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr3P43300 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr3P43300 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Egr3P43300 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr3P43300 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Egr3P43300 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms