Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms