Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tac1P41539 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms