Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfc1P35601 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms