Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpardP35396 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpardP35396 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpardP35396 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpardP35396 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpardP35396 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpardP35396 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpardP35396 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpardP35396 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PpardP35396 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PpardP35396 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PpardP35396 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PpardP35396 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PpardP35396 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpardP35396 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpardP35396 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpardP35396 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpardP35396 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpardP35396 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpardP35396 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms