Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms