Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd1P33215 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms