Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rom1P32958 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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