Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms