Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxraP28700 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxraP28700 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxraP28700 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RxraP28700 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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