Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms