Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa2P28309 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa2P28309 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms