Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms