Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb1P28230 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms