Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjc1P28229 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms