Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-DMaP28078 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms