Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms