Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BrafP28028 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BrafP28028 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BrafP28028 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BrafP28028 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BrafP28028 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BrafP28028 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BrafP28028 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BrafP28028 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BrafP28028 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BrafP28028 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BrafP28028 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BrafP28028 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BrafP28028 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BrafP28028 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BrafP28028 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BrafP28028 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms