Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms