Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms