Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Ctnna1P26231 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms