Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk11bP24788 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms