Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd247P24161 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd247P24161 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd247P24161 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms