Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Hoxd11P23813 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms