Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms