Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms