Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd8P23463 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms