Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tap1P21958 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tap1P21958 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tap1P21958 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms