Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TrhrP21761 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrhrP21761 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms