Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cst3P21460 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cst3P21460 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms