Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms