Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TP20293 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TP20293 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TP20293 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TP20293 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TP20293 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TP20293 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TP20293 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TP20293 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TP20293 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TP20293 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TP20293 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TP20293 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms