Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms