Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18533 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18533 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18533 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18533 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18533 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P18533 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18533 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18533 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18533 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18533 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18533 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18533 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18533 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18533 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18533 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18533 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18533 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18533 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18533 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18533 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18533 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms