Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb1P17919 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms