Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms