Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp53P15975 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp53P15975 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp53P15975 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms