Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms