Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q9P14431 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms