Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms