Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg5P12961 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg5P12961 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg5P12961 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg5P12961 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg5P12961 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg5P12961 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg5P12961 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg5P12961 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms