Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms