Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fv4P11370 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fv4P11370 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fv4P11370 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms