Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lire1P11260 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lire1P11260 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lire1P11260 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms